礦山工程資質公司股權轉讓是指礦山工程資質公司的股東將其持有的公司股份轉讓給其他人或者單位，從而改變公司的股權結構和控制權。礦山工程資質公司股權轉讓有以下幾個流程：

一、雙方簽訂股權轉讓協議

股權轉讓協議是礦山工程資質公司股權轉讓的基礎文件，雙方應當在協議中明確約定轉讓的股份比例、價格、支付方式、時間、責任等事項，并按照法律規定進行公證。股權轉讓協議應當符合《公司法》《合同法》等相關法律法規的要求，否則可能導致協議無效或者被撤銷。

二、辦理工商變更登記

根據《公司法》第一百四十七條的規定，公司股東變更的，應當向工商行政管理部門申請變更登記。礦山工程資質公司股權轉讓后，應當在協議簽訂之日起三十日內，向原登記機關提交以下材料：

1.股權轉讓協議及公證書

2.股東會或者董事會決議

3.股東名冊及出資情況

4.股東身份證明或者營業執照

5.公司章程修正案

6.其他相關材料

工商行政管理部門在收到上述材料后，應當在十五個工作日內審查并核發新的營業執照。

三、辦理稅務登記和繳納稅款

礦山工程資質公司股權轉讓后，應當在工商變更登記完成之日起三十日內，向稅務機關辦理稅務登記，并按照稅法規定繳納相關稅款。根據《企業所得稅法》第四十五條的規定，企業之間的股權轉讓，應當按照轉讓價款與原值之間的差額計算企業所得稅。此外，根據《營業稅暫行條例》第三條第一款第六項的規定，企業之間的股權轉讓，也應當繳納營業稅。具體的稅率和計算方法，應當參考相關稅務部門的規定和指導。

四、辦理其他相關手續

礦山工程資質公司股權轉讓后，還應當根據實際情況，辦理其他相關手續，例如：

1.向原發證機關申請變更礦山工程資質證書

2.向銀行等金融機構辦理賬戶變更或者開立新賬戶

3.向社保、公積金等部門辦理員工社保、公積金等事宜

4.向客戶、供應商、合作伙伴等通知股權轉讓的情況，并簽署新的合同或者協議